Separación isotópica
INVAP ha desarrollado dos métodos para la separación isotópica: el de difusión gaseosa y el basado en láser.
Manejo, transporte y almacenamiento de combustibles agotados
INVAP diseña y construye sistemas de almacenamiento de combustibles agotados. El almacenaje en seco significa menor mantenimiento y costo de operación además de ser más seguro. El sistema permite la supervisión de los elementos combustibles agotados aún en decaimiento. Se considera actualmente que este tipo de instalación configura una solución optimizada intermedia a la disposición final o reprocesamiento de los elementos combustibles nucleares agotados. 
Enriquecimiento de uranio
La separación por el método de difusión gaseosa se desarrolló e implementó para la Comisión Nacional de Energía Atómica argentina (CNEA) en la Planta de Enriquecimiento de Uranio ubicada en la localidad de Pilcaniyeu, Río Negro, Argentina, hasta comienzos de la década de los 90. Para esta planta, INVAP realizó:
• El desarrollo de todos los procesos involucrados.
• El diseño, la fabricación y el montaje de todos los equipos de proceso.
• El diseño y la construcción de la planta.
• La puesta en marcha.
También operó y mantuvo la planta por cuenta de CNEA.
Destritiado de agua pesada
La separación del tritio radiactivo generado en reactores de agua pesada es una de las necesidades de los reactores que la utilizan como moderador. INVAP ha desarrollado y montado una instalación piloto basada en el proceso láser de separación isotópica en sus laboratorios de Villa Golf, Bariloche.
